Segunda Temporada
La segunda temporada se estrenó en los Estados Unidos y Canada el 21 de agosto de 2006. La historia continúa 8 horas después de los sucesos acaecidos en el último episodio de la primera temporada, haciendo énfasis en los fugados y desarrollando una serie de tramas principales. En esta temporada se introducen nuevos personajes, incluyendo al agente federal Alexander Mahone (William Fichtner), el cual es asignado para perseguir y capturar a los ocho presos (que se lanzan a una búsqueda desesperada para encontrar el dinero de Westmoreland). Mientras, "La Compañía" continúa con su plan de localizar y eliminar a Lincoln Burrows y a los que se pongan en su camino.